Jar、war在文件结构上，二者并没有什么不同，它们都采用zip或jar档案文件压缩格式。但是它们的使用目的有所区别：

jar

1.Jar文件（扩展名为. Jar，Java Application Archive）包含Java类的普通库、资源（resources）、辅助文件（auxiliary files）等。
2.jar包是java打的包，一般只是包括一些 编译后class文件和一些部署文件 ，在声明了Main_class之后是可以用java命令运行的。
3.jar包通常是开发时要引用通用类，打成包便于存放管理。

war

1.War文件（扩展名为.War,Web Application Archive）包含全部Web应用程序。在这种情形下，一个Web应用程序被定义为单独的一组文件、类和资源，用户可以对war文件进行封装，并把它作为小型服务程序（servlet）来访问。
2.war包可以理解为javaweb打的包，是一个web模块，包括写的代码 编译成的class文件，依赖的包，配置文件，所有的网站页面，包括html，jsp 等等。一个war包可以理解为是一个web项目，里面是项目的所有东西。
3.war包需要发布到一个容器里面，拿Tomcat来说,将war文件包放置它的\webapps\目录下，启动Tomcat,这个包可以自动进行解压，也就是你的web目录，相当于发布了。
4.WAR是Sun提出的一种Web应用程序格式，与JAR类似，也是许多文件的一个压缩包。这个包中的文件按一定目录结构来组织：通常其根目录下包含有Html和Jsp文件或者包含这两种文件的目录，另外还会有一个WEB- INF目录，这个目录很重要。通常在WEB- INF目录下有一个web.xml文件和一个classes目录，web.xml是这个应用的配置文件，而classes目录下则包含编译好的Servlet类和Jsp或Servlet所依赖的其它类（JavaBean）。